Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV32

Arpc1b, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc1bQ9WV32 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arpc1bQ9WV32 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arpc1bQ9WV32 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arpc1bQ9WV32 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arpc1bQ9WV32 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arpc1bQ9WV32 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arpc1bQ9WV32 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arpc1bQ9WV32 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arpc1bQ9WV32 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arpc1bQ9WV32 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arpc1bQ9WV32 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arpc1bQ9WV32 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arpc1bQ9WV32 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arpc1bQ9WV32 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arpc1bQ9WV32 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Arpc1bQ9WV32 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Arpc1bQ9WV32 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arpc1bQ9WV32 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arpc1bQ9WV32 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arpc1bQ9WV32 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arpc1bQ9WV32 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arpc1bQ9WV32 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arpc1bQ9WV32 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arpc1bQ9WV32 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arpc1bQ9WV32 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arpc1bQ9WV32 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arpc1bQ9WV32 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arpc1bQ9WV32 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arpc1bQ9WV32 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arpc1bQ9WV32 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arpc1bQ9WV32 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arpc1bQ9WV32 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arpc1bQ9WV32 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arpc1bQ9WV32 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arpc1bQ9WV32 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arpc1bQ9WV32 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 187.4 ms