Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp1a4Q9WV27 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp1a4Q9WV27 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp1a4Q9WV27 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp1a4Q9WV27 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp1a4Q9WV27 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1a4Q9WV27 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1a4Q9WV27 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1a4Q9WV27 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1a4Q9WV27 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1a4Q9WV27 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp1a4Q9WV27 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp1a4Q9WV27 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp1a4Q9WV27 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp1a4Q9WV27 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp1a4Q9WV27 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp1a4Q9WV27 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp1a4Q9WV27 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp1a4Q9WV27 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp1a4Q9WV27 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp1a4Q9WV27 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp1a4Q9WV27 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp1a4Q9WV27 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp1a4Q9WV27 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp1a4Q9WV27 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp1a4Q9WV27 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp1a4Q9WV27 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp1a4Q9WV27 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp1a4Q9WV27 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp1a4Q9WV27 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp1a4Q9WV27 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp1a4Q9WV27 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp1a4Q9WV27 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp1a4Q9WV27 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp1a4Q9WV27 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp1a4Q9WV27 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp1a4Q9WV27 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp1a4Q9WV27 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp1a4Q9WV27 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp1a4Q9WV27 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp1a4Q9WV27 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp1a4Q9WV27 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp1a4Q9WV27 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp1a4Q9WV27 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp1a4Q9WV27 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp1a4Q9WV27 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp1a4Q9WV27 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp1a4Q9WV27 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp1a4Q9WV27 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp1a4Q9WV27 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp1a4Q9WV27 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp1a4Q9WV27 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp1a4Q9WV27 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp1a4Q9WV27 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp1a4Q9WV27 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp1a4Q9WV27 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp1a4Q9WV27 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp1a4Q9WV27 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp1a4Q9WV27 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp1a4Q9WV27 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp1a4Q9WV27 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp1a4Q9WV27 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp1a4Q9WV27 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp1a4Q9WV27 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp1a4Q9WV27 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp1a4Q9WV27 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp1a4Q9WV27 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp1a4Q9WV27 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp1a4Q9WV27 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp1a4Q9WV27 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp1a4Q9WV27 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp1a4Q9WV27 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp1a4Q9WV27 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp1a4Q9WV27 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp1a4Q9WV27 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp1a4Q9WV27 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp1a4Q9WV27 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp1a4Q9WV27 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp1a4Q9WV27 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp1a4Q9WV27 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp1a4Q9WV27 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp1a4Q9WV27 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp1a4Q9WV27 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp1a4Q9WV27 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp1a4Q9WV27 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp1a4Q9WV27 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp1a4Q9WV27 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms