Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUM3

Coro1b, Coronin-1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Coro1bQ9WUM3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Coro1bQ9WUM3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Coro1bQ9WUM3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Coro1bQ9WUM3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Coro1bQ9WUM3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Coro1bQ9WUM3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Coro1bQ9WUM3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Coro1bQ9WUM3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Coro1bQ9WUM3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Coro1bQ9WUM3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Coro1bQ9WUM3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Coro1bQ9WUM3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Coro1bQ9WUM3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Coro1bQ9WUM3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Coro1bQ9WUM3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Coro1bQ9WUM3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Coro1bQ9WUM3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Coro1bQ9WUM3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Coro1bQ9WUM3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Coro1bQ9WUM3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Coro1bQ9WUM3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Coro1bQ9WUM3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Coro1bQ9WUM3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Coro1bQ9WUM3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Coro1bQ9WUM3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Coro1bQ9WUM3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Coro1bQ9WUM3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Coro1bQ9WUM3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Coro1bQ9WUM3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Coro1bQ9WUM3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Coro1bQ9WUM3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Coro1bQ9WUM3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Coro1bQ9WUM3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Coro1bQ9WUM3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms