Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH5

Trim10, Tripartite motif-containing protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim10Q9WUH5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim10Q9WUH5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim10Q9WUH5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim10Q9WUH5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim10Q9WUH5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim10Q9WUH5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim10Q9WUH5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim10Q9WUH5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim10Q9WUH5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim10Q9WUH5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim10Q9WUH5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim10Q9WUH5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim10Q9WUH5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim10Q9WUH5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim10Q9WUH5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim10Q9WUH5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim10Q9WUH5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim10Q9WUH5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim10Q9WUH5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim10Q9WUH5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim10Q9WUH5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim10Q9WUH5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim10Q9WUH5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim10Q9WUH5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim10Q9WUH5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim10Q9WUH5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim10Q9WUH5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim10Q9WUH5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim10Q9WUH5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim10Q9WUH5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim10Q9WUH5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim10Q9WUH5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim10Q9WUH5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim10Q9WUH5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim10Q9WUH5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim10Q9WUH5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim10Q9WUH5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim10Q9WUH5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim10Q9WUH5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim10Q9WUH5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim10Q9WUH5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim10Q9WUH5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim10Q9WUH5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim10Q9WUH5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim10Q9WUH5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Trim10Q9WUH5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Trim10Q9WUH5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim10Q9WUH5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim10Q9WUH5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim10Q9WUH5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim10Q9WUH5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim10Q9WUH5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim10Q9WUH5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim10Q9WUH5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim10Q9WUH5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim10Q9WUH5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim10Q9WUH5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim10Q9WUH5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim10Q9WUH5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim10Q9WUH5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim10Q9WUH5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim10Q9WUH5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim10Q9WUH5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim10Q9WUH5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim10Q9WUH5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim10Q9WUH5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim10Q9WUH5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim10Q9WUH5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim10Q9WUH5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim10Q9WUH5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim10Q9WUH5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim10Q9WUH5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim10Q9WUH5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim10Q9WUH5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim10Q9WUH5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim10Q9WUH5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim10Q9WUH5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim10Q9WUH5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim10Q9WUH5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim10Q9WUH5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim10Q9WUH5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim10Q9WUH5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim10Q9WUH5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim10Q9WUH5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim10Q9WUH5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim10Q9WUH5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim10Q9WUH5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim10Q9WUH5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim10Q9WUH5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim10Q9WUH5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim10Q9WUH5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim10Q9WUH5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim10Q9WUH5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim10Q9WUH5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim10Q9WUH5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim10Q9WUH5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim10Q9WUH5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim10Q9WUH5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim10Q9WUH5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim10Q9WUH5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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