Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pfdn5Q9WU28 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pfdn5Q9WU28 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pfdn5Q9WU28 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pfdn5Q9WU28 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pfdn5Q9WU28 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pfdn5Q9WU28 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pfdn5Q9WU28 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pfdn5Q9WU28 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pfdn5Q9WU28 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pfdn5Q9WU28 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pfdn5Q9WU28 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pfdn5Q9WU28 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pfdn5Q9WU28 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pfdn5Q9WU28 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms