Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PrkraQ9WTX2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PrkraQ9WTX2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PrkraQ9WTX2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PrkraQ9WTX2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PrkraQ9WTX2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkraQ9WTX2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkraQ9WTX2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkraQ9WTX2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkraQ9WTX2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkraQ9WTX2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkraQ9WTX2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkraQ9WTX2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkraQ9WTX2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkraQ9WTX2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkraQ9WTX2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkraQ9WTX2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkraQ9WTX2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkraQ9WTX2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkraQ9WTX2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkraQ9WTX2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkraQ9WTX2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkraQ9WTX2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkraQ9WTX2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PrkraQ9WTX2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PrkraQ9WTX2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PrkraQ9WTX2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PrkraQ9WTX2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PrkraQ9WTX2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PrkraQ9WTX2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PrkraQ9WTX2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PrkraQ9WTX2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PrkraQ9WTX2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PrkraQ9WTX2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PrkraQ9WTX2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkraQ9WTX2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkraQ9WTX2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkraQ9WTX2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkraQ9WTX2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkraQ9WTX2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkraQ9WTX2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkraQ9WTX2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms