Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc2Q9R244 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc2Q9R244 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpc2Q9R244 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpc2Q9R244 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpc2Q9R244 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpc2Q9R244 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpc2Q9R244 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpc2Q9R244 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpc2Q9R244 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpc2Q9R244 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpc2Q9R244 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpc2Q9R244 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpc2Q9R244 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpc2Q9R244 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpc2Q9R244 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpc2Q9R244 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpc2Q9R244 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpc2Q9R244 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpc2Q9R244 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpc2Q9R244 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpc2Q9R244 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpc2Q9R244 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpc2Q9R244 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpc2Q9R244 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpc2Q9R244 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpc2Q9R244 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpc2Q9R244 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpc2Q9R244 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpc2Q9R244 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpc2Q9R244 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpc2Q9R244 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpc2Q9R244 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpc2Q9R244 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpc2Q9R244 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpc2Q9R244 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpc2Q9R244 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpc2Q9R244 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpc2Q9R244 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpc2Q9R244 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpc2Q9R244 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpc2Q9R244 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpc2Q9R244 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpc2Q9R244 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpc2Q9R244 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpc2Q9R244 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpc2Q9R244 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Trpc2Q9R244 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpc2Q9R244 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpc2Q9R244 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpc2Q9R244 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpc2Q9R244 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpc2Q9R244 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpc2Q9R244 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpc2Q9R244 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpc2Q9R244 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpc2Q9R244 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpc2Q9R244 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpc2Q9R244 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpc2Q9R244 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpc2Q9R244 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpc2Q9R244 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpc2Q9R244 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpc2Q9R244 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpc2Q9R244 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpc2Q9R244 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpc2Q9R244 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpc2Q9R244 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpc2Q9R244 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpc2Q9R244 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpc2Q9R244 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpc2Q9R244 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpc2Q9R244 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpc2Q9R244 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpc2Q9R244 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpc2Q9R244 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpc2Q9R244 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpc2Q9R244 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpc2Q9R244 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpc2Q9R244 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpc2Q9R244 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpc2Q9R244 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpc2Q9R244 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpc2Q9R244 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpc2Q9R244 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpc2Q9R244 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpc2Q9R244 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpc2Q9R244 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpc2Q9R244 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpc2Q9R244 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpc2Q9R244 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpc2Q9R244 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trpc2Q9R244 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpc2Q9R244 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpc2Q9R244 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpc2Q9R244 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpc2Q9R244 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpc2Q9R244 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpc2Q9R244 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpc2Q9R244 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms