Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Q9

Atp6ap1, V-type proton ATPase subunit S1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1Q9R1Q9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp6ap1Q9R1Q9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp6ap1Q9R1Q9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp6ap1Q9R1Q9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp6ap1Q9R1Q9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp6ap1Q9R1Q9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp6ap1Q9R1Q9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp6ap1Q9R1Q9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp6ap1Q9R1Q9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp6ap1Q9R1Q9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp6ap1Q9R1Q9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp6ap1Q9R1Q9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp6ap1Q9R1Q9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp6ap1Q9R1Q9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp6ap1Q9R1Q9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp6ap1Q9R1Q9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp6ap1Q9R1Q9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp6ap1Q9R1Q9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp6ap1Q9R1Q9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp6ap1Q9R1Q9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp6ap1Q9R1Q9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp6ap1Q9R1Q9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp6ap1Q9R1Q9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp6ap1Q9R1Q9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp6ap1Q9R1Q9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp6ap1Q9R1Q9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp6ap1Q9R1Q9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp6ap1Q9R1Q9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp6ap1Q9R1Q9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp6ap1Q9R1Q9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp6ap1Q9R1Q9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp6ap1Q9R1Q9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp6ap1Q9R1Q9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp6ap1Q9R1Q9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp6ap1Q9R1Q9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp6ap1Q9R1Q9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp6ap1Q9R1Q9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp6ap1Q9R1Q9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp6ap1Q9R1Q9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp6ap1Q9R1Q9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp6ap1Q9R1Q9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp6ap1Q9R1Q9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp6ap1Q9R1Q9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp6ap1Q9R1Q9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp6ap1Q9R1Q9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp6ap1Q9R1Q9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp6ap1Q9R1Q9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp6ap1Q9R1Q9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp6ap1Q9R1Q9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp6ap1Q9R1Q9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp6ap1Q9R1Q9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp6ap1Q9R1Q9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp6ap1Q9R1Q9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp6ap1Q9R1Q9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp6ap1Q9R1Q9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp6ap1Q9R1Q9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp6ap1Q9R1Q9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp6ap1Q9R1Q9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp6ap1Q9R1Q9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp6ap1Q9R1Q9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp6ap1Q9R1Q9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp6ap1Q9R1Q9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp6ap1Q9R1Q9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp6ap1Q9R1Q9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp6ap1Q9R1Q9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp6ap1Q9R1Q9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp6ap1Q9R1Q9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp6ap1Q9R1Q9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp6ap1Q9R1Q9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp6ap1Q9R1Q9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp6ap1Q9R1Q9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp6ap1Q9R1Q9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp6ap1Q9R1Q9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp6ap1Q9R1Q9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp6ap1Q9R1Q9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp6ap1Q9R1Q9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp6ap1Q9R1Q9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp6ap1Q9R1Q9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp6ap1Q9R1Q9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp6ap1Q9R1Q9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp6ap1Q9R1Q9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp6ap1Q9R1Q9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atp6ap1Q9R1Q9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atp6ap1Q9R1Q9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atp6ap1Q9R1Q9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atp6ap1Q9R1Q9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atp6ap1Q9R1Q9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atp6ap1Q9R1Q9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atp6ap1Q9R1Q9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp6ap1Q9R1Q9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp6ap1Q9R1Q9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp6ap1Q9R1Q9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp6ap1Q9R1Q9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms