Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0N9

Syt9, Synaptotagmin-9, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt9Q9R0N9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syt9Q9R0N9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syt9Q9R0N9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syt9Q9R0N9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syt9Q9R0N9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syt9Q9R0N9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syt9Q9R0N9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syt9Q9R0N9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syt9Q9R0N9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syt9Q9R0N9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syt9Q9R0N9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syt9Q9R0N9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syt9Q9R0N9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syt9Q9R0N9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syt9Q9R0N9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Syt9Q9R0N9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Syt9Q9R0N9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syt9Q9R0N9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syt9Q9R0N9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syt9Q9R0N9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syt9Q9R0N9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syt9Q9R0N9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syt9Q9R0N9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syt9Q9R0N9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syt9Q9R0N9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syt9Q9R0N9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syt9Q9R0N9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syt9Q9R0N9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syt9Q9R0N9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syt9Q9R0N9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syt9Q9R0N9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syt9Q9R0N9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syt9Q9R0N9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syt9Q9R0N9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syt9Q9R0N9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms