Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NrkQ9R0G8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NrkQ9R0G8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NrkQ9R0G8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NrkQ9R0G8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
NrkQ9R0G8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NrkQ9R0G8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NrkQ9R0G8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NrkQ9R0G8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NrkQ9R0G8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
NrkQ9R0G8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NrkQ9R0G8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NrkQ9R0G8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NrkQ9R0G8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NrkQ9R0G8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NrkQ9R0G8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
NrkQ9R0G8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
NrkQ9R0G8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
NrkQ9R0G8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NrkQ9R0G8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NrkQ9R0G8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NrkQ9R0G8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
NrkQ9R0G8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
NrkQ9R0G8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NrkQ9R0G8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NrkQ9R0G8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NrkQ9R0G8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NrkQ9R0G8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
NrkQ9R0G8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
NrkQ9R0G8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NrkQ9R0G8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NrkQ9R0G8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NrkQ9R0G8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NrkQ9R0G8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NrkQ9R0G8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NrkQ9R0G8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
NrkQ9R0G8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NrkQ9R0G8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
NrkQ9R0G8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NrkQ9R0G8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NrkQ9R0G8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NrkQ9R0G8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NrkQ9R0G8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
NrkQ9R0G8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NrkQ9R0G8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NrkQ9R0G8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NrkQ9R0G8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
NrkQ9R0G8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
NrkQ9R0G8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
NrkQ9R0G8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NrkQ9R0G8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
NrkQ9R0G8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NrkQ9R0G8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
NrkQ9R0G8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NrkQ9R0G8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NrkQ9R0G8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
NrkQ9R0G8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NrkQ9R0G8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NrkQ9R0G8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NrkQ9R0G8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NrkQ9R0G8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NrkQ9R0G8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NrkQ9R0G8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NrkQ9R0G8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NrkQ9R0G8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NrkQ9R0G8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NrkQ9R0G8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
NrkQ9R0G8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NrkQ9R0G8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NrkQ9R0G8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NrkQ9R0G8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NrkQ9R0G8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NrkQ9R0G8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NrkQ9R0G8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NrkQ9R0G8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NrkQ9R0G8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
NrkQ9R0G8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
NrkQ9R0G8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NrkQ9R0G8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
NrkQ9R0G8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NrkQ9R0G8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NrkQ9R0G8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NrkQ9R0G8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NrkQ9R0G8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NrkQ9R0G8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NrkQ9R0G8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NrkQ9R0G8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NrkQ9R0G8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NrkQ9R0G8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NrkQ9R0G8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NrkQ9R0G8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
NrkQ9R0G8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
NrkQ9R0G8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NrkQ9R0G8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NrkQ9R0G8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NrkQ9R0G8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NrkQ9R0G8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
NrkQ9R0G8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NrkQ9R0G8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NrkQ9R0G8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms