Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zeb2Q9R0G7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zeb2Q9R0G7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Zeb2Q9R0G7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zeb2Q9R0G7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zeb2Q9R0G7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Zeb2Q9R0G7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Zeb2Q9R0G7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Zeb2Q9R0G7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zeb2Q9R0G7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zeb2Q9R0G7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zeb2Q9R0G7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zeb2Q9R0G7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zeb2Q9R0G7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zeb2Q9R0G7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zeb2Q9R0G7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Zeb2Q9R0G7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Zeb2Q9R0G7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Zeb2Q9R0G7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Zeb2Q9R0G7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Zeb2Q9R0G7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Zeb2Q9R0G7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zeb2Q9R0G7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zeb2Q9R0G7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Zeb2Q9R0G7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zeb2Q9R0G7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zeb2Q9R0G7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Zeb2Q9R0G7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Zeb2Q9R0G7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Zeb2Q9R0G7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Zeb2Q9R0G7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Zeb2Q9R0G7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Zeb2Q9R0G7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Zeb2Q9R0G7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Zeb2Q9R0G7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Zeb2Q9R0G7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Zeb2Q9R0G7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Zeb2Q9R0G7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Zeb2Q9R0G7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Zeb2Q9R0G7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zeb2Q9R0G7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zeb2Q9R0G7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zeb2Q9R0G7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zeb2Q9R0G7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zeb2Q9R0G7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zeb2Q9R0G7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zeb2Q9R0G7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Zeb2Q9R0G7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Zeb2Q9R0G7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Zeb2Q9R0G7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Zeb2Q9R0G7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Zeb2Q9R0G7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Zeb2Q9R0G7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zeb2Q9R0G7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zeb2Q9R0G7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zeb2Q9R0G7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zeb2Q9R0G7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zeb2Q9R0G7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zeb2Q9R0G7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Zeb2Q9R0G7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Zeb2Q9R0G7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Zeb2Q9R0G7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Zeb2Q9R0G7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Zeb2Q9R0G7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Zeb2Q9R0G7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Zeb2Q9R0G7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Zeb2Q9R0G7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Zeb2Q9R0G7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Zeb2Q9R0G7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Zeb2Q9R0G7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zeb2Q9R0G7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zeb2Q9R0G7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zeb2Q9R0G7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zeb2Q9R0G7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zeb2Q9R0G7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zeb2Q9R0G7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zeb2Q9R0G7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zeb2Q9R0G7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zeb2Q9R0G7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zeb2Q9R0G7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zeb2Q9R0G7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zeb2Q9R0G7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zeb2Q9R0G7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zeb2Q9R0G7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zeb2Q9R0G7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zeb2Q9R0G7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zeb2Q9R0G7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zeb2Q9R0G7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zeb2Q9R0G7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zeb2Q9R0G7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zeb2Q9R0G7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zeb2Q9R0G7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zeb2Q9R0G7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zeb2Q9R0G7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zeb2Q9R0G7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zeb2Q9R0G7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zeb2Q9R0G7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zeb2Q9R0G7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zeb2Q9R0G7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zeb2Q9R0G7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms