Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B7

Znf346, Zinc finger protein 346, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf346Q9R0B7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Znf346Q9R0B7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf346Q9R0B7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf346Q9R0B7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf346Q9R0B7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf346Q9R0B7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf346Q9R0B7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf346Q9R0B7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf346Q9R0B7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf346Q9R0B7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf346Q9R0B7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf346Q9R0B7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf346Q9R0B7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf346Q9R0B7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf346Q9R0B7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf346Q9R0B7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf346Q9R0B7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf346Q9R0B7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf346Q9R0B7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf346Q9R0B7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf346Q9R0B7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf346Q9R0B7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf346Q9R0B7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf346Q9R0B7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf346Q9R0B7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf346Q9R0B7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf346Q9R0B7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf346Q9R0B7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf346Q9R0B7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms