Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp11cQ9QZW0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp11cQ9QZW0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp11cQ9QZW0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp11cQ9QZW0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp11cQ9QZW0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atp11cQ9QZW0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp11cQ9QZW0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp11cQ9QZW0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp11cQ9QZW0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp11cQ9QZW0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp11cQ9QZW0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp11cQ9QZW0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp11cQ9QZW0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp11cQ9QZW0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp11cQ9QZW0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp11cQ9QZW0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp11cQ9QZW0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp11cQ9QZW0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp11cQ9QZW0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp11cQ9QZW0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp11cQ9QZW0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp11cQ9QZW0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp11cQ9QZW0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp11cQ9QZW0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp11cQ9QZW0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp11cQ9QZW0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp11cQ9QZW0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp11cQ9QZW0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp11cQ9QZW0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp11cQ9QZW0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp11cQ9QZW0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms