Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Npas3Q9QZQ0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Npas3Q9QZQ0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Npas3Q9QZQ0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Npas3Q9QZQ0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Npas3Q9QZQ0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Npas3Q9QZQ0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Npas3Q9QZQ0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Npas3Q9QZQ0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Npas3Q9QZQ0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Npas3Q9QZQ0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Npas3Q9QZQ0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Npas3Q9QZQ0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Npas3Q9QZQ0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Npas3Q9QZQ0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Npas3Q9QZQ0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Npas3Q9QZQ0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Npas3Q9QZQ0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Npas3Q9QZQ0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Npas3Q9QZQ0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Npas3Q9QZQ0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Npas3Q9QZQ0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Npas3Q9QZQ0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Npas3Q9QZQ0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Npas3Q9QZQ0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Npas3Q9QZQ0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Npas3Q9QZQ0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Npas3Q9QZQ0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Npas3Q9QZQ0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Npas3Q9QZQ0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Npas3Q9QZQ0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Npas3Q9QZQ0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Npas3Q9QZQ0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Npas3Q9QZQ0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Npas3Q9QZQ0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Npas3Q9QZQ0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Npas3Q9QZQ0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Npas3Q9QZQ0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Npas3Q9QZQ0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Npas3Q9QZQ0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Npas3Q9QZQ0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Npas3Q9QZQ0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Npas3Q9QZQ0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Npas3Q9QZQ0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Npas3Q9QZQ0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Npas3Q9QZQ0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Npas3Q9QZQ0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Npas3Q9QZQ0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Npas3Q9QZQ0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Npas3Q9QZQ0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Npas3Q9QZQ0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Npas3Q9QZQ0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Npas3Q9QZQ0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Npas3Q9QZQ0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Npas3Q9QZQ0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Npas3Q9QZQ0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Npas3Q9QZQ0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Npas3Q9QZQ0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Npas3Q9QZQ0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Npas3Q9QZQ0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Npas3Q9QZQ0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Npas3Q9QZQ0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Npas3Q9QZQ0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Npas3Q9QZQ0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Npas3Q9QZQ0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Npas3Q9QZQ0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Npas3Q9QZQ0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Npas3Q9QZQ0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Npas3Q9QZQ0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms