Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ripk3Q9QZL0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ripk3Q9QZL0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ripk3Q9QZL0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ripk3Q9QZL0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ripk3Q9QZL0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ripk3Q9QZL0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ripk3Q9QZL0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ripk3Q9QZL0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ripk3Q9QZL0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ripk3Q9QZL0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ripk3Q9QZL0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ripk3Q9QZL0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ripk3Q9QZL0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ripk3Q9QZL0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ripk3Q9QZL0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ripk3Q9QZL0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ripk3Q9QZL0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ripk3Q9QZL0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ripk3Q9QZL0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ripk3Q9QZL0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ripk3Q9QZL0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ripk3Q9QZL0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ripk3Q9QZL0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ripk3Q9QZL0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ripk3Q9QZL0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ripk3Q9QZL0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ripk3Q9QZL0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ripk3Q9QZL0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ripk3Q9QZL0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ripk3Q9QZL0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ripk3Q9QZL0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ripk3Q9QZL0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ripk3Q9QZL0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ripk3Q9QZL0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ripk3Q9QZL0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ripk3Q9QZL0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ripk3Q9QZL0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ripk3Q9QZL0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ripk3Q9QZL0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ripk3Q9QZL0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ripk3Q9QZL0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ripk3Q9QZL0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ripk3Q9QZL0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ripk3Q9QZL0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ripk3Q9QZL0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ripk3Q9QZL0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ripk3Q9QZL0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ripk3Q9QZL0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ripk3Q9QZL0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ripk3Q9QZL0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ripk3Q9QZL0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ripk3Q9QZL0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ripk3Q9QZL0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ripk3Q9QZL0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ripk3Q9QZL0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ripk3Q9QZL0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ripk3Q9QZL0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ripk3Q9QZL0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ripk3Q9QZL0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ripk3Q9QZL0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ripk3Q9QZL0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ripk3Q9QZL0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ripk3Q9QZL0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ripk3Q9QZL0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ripk3Q9QZL0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ripk3Q9QZL0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ripk3Q9QZL0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ripk3Q9QZL0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ripk3Q9QZL0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ripk3Q9QZL0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ripk3Q9QZL0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ripk3Q9QZL0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ripk3Q9QZL0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ripk3Q9QZL0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ripk3Q9QZL0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ripk3Q9QZL0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ripk3Q9QZL0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ripk3Q9QZL0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ripk3Q9QZL0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ripk3Q9QZL0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ripk3Q9QZL0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ripk3Q9QZL0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ripk3Q9QZL0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ripk3Q9QZL0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ripk3Q9QZL0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ripk3Q9QZL0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ripk3Q9QZL0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ripk3Q9QZL0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ripk3Q9QZL0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ripk3Q9QZL0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ripk3Q9QZL0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ripk3Q9QZL0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ripk3Q9QZL0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ripk3Q9QZL0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ripk3Q9QZL0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ripk3Q9QZL0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ripk3Q9QZL0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ripk3Q9QZL0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ripk3Q9QZL0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms