Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ercc4Q9QZD4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ercc4Q9QZD4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ercc4Q9QZD4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ercc4Q9QZD4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ercc4Q9QZD4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ercc4Q9QZD4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ercc4Q9QZD4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ercc4Q9QZD4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ercc4Q9QZD4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ercc4Q9QZD4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ercc4Q9QZD4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ercc4Q9QZD4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ercc4Q9QZD4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ercc4Q9QZD4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ercc4Q9QZD4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ercc4Q9QZD4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ercc4Q9QZD4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ercc4Q9QZD4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ercc4Q9QZD4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ercc4Q9QZD4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ercc4Q9QZD4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ercc4Q9QZD4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ercc4Q9QZD4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ercc4Q9QZD4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ercc4Q9QZD4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ercc4Q9QZD4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ercc4Q9QZD4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ercc4Q9QZD4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ercc4Q9QZD4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ercc4Q9QZD4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ercc4Q9QZD4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ercc4Q9QZD4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ercc4Q9QZD4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ercc4Q9QZD4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ercc4Q9QZD4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ercc4Q9QZD4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ercc4Q9QZD4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ercc4Q9QZD4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ercc4Q9QZD4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ercc4Q9QZD4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ercc4Q9QZD4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ercc4Q9QZD4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ercc4Q9QZD4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ercc4Q9QZD4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ercc4Q9QZD4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ercc4Q9QZD4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms