Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubxn8Q9QZ49 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubxn8Q9QZ49 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubxn8Q9QZ49 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubxn8Q9QZ49 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubxn8Q9QZ49 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubxn8Q9QZ49 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubxn8Q9QZ49 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubxn8Q9QZ49 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubxn8Q9QZ49 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubxn8Q9QZ49 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubxn8Q9QZ49 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubxn8Q9QZ49 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubxn8Q9QZ49 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubxn8Q9QZ49 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubxn8Q9QZ49 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubxn8Q9QZ49 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubxn8Q9QZ49 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubxn8Q9QZ49 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubxn8Q9QZ49 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubxn8Q9QZ49 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubxn8Q9QZ49 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubxn8Q9QZ49 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubxn8Q9QZ49 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubxn8Q9QZ49 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubxn8Q9QZ49 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubxn8Q9QZ49 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubxn8Q9QZ49 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubxn8Q9QZ49 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubxn8Q9QZ49 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubxn8Q9QZ49 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubxn8Q9QZ49 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ubxn8Q9QZ49 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ubxn8Q9QZ49 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ubxn8Q9QZ49 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ubxn8Q9QZ49 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ubxn8Q9QZ49 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ubxn8Q9QZ49 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ubxn8Q9QZ49 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubxn8Q9QZ49 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubxn8Q9QZ49 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubxn8Q9QZ49 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubxn8Q9QZ49 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubxn8Q9QZ49 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubxn8Q9QZ49 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubxn8Q9QZ49 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubxn8Q9QZ49 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubxn8Q9QZ49 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubxn8Q9QZ49 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubxn8Q9QZ49 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubxn8Q9QZ49 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubxn8Q9QZ49 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubxn8Q9QZ49 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubxn8Q9QZ49 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubxn8Q9QZ49 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubxn8Q9QZ49 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubxn8Q9QZ49 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubxn8Q9QZ49 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubxn8Q9QZ49 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubxn8Q9QZ49 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubxn8Q9QZ49 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubxn8Q9QZ49 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubxn8Q9QZ49 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubxn8Q9QZ49 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubxn8Q9QZ49 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubxn8Q9QZ49 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubxn8Q9QZ49 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubxn8Q9QZ49 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubxn8Q9QZ49 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubxn8Q9QZ49 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubxn8Q9QZ49 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubxn8Q9QZ49 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubxn8Q9QZ49 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubxn8Q9QZ49 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubxn8Q9QZ49 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubxn8Q9QZ49 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubxn8Q9QZ49 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubxn8Q9QZ49 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubxn8Q9QZ49 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubxn8Q9QZ49 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ubxn8Q9QZ49 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ubxn8Q9QZ49 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ubxn8Q9QZ49 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ubxn8Q9QZ49 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ubxn8Q9QZ49 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ubxn8Q9QZ49 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ubxn8Q9QZ49 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ubxn8Q9QZ49 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubxn8Q9QZ49 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubxn8Q9QZ49 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubxn8Q9QZ49 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubxn8Q9QZ49 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubxn8Q9QZ49 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubxn8Q9QZ49 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubxn8Q9QZ49 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubxn8Q9QZ49 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubxn8Q9QZ49 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubxn8Q9QZ49 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubxn8Q9QZ49 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubxn8Q9QZ49 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms