Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYY0

Gab1, GRB2-associated-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gab1Q9QYY0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gab1Q9QYY0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gab1Q9QYY0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gab1Q9QYY0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gab1Q9QYY0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gab1Q9QYY0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gab1Q9QYY0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gab1Q9QYY0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gab1Q9QYY0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gab1Q9QYY0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gab1Q9QYY0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gab1Q9QYY0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gab1Q9QYY0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gab1Q9QYY0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gab1Q9QYY0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gab1Q9QYY0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gab1Q9QYY0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gab1Q9QYY0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gab1Q9QYY0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gab1Q9QYY0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gab1Q9QYY0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gab1Q9QYY0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gab1Q9QYY0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gab1Q9QYY0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gab1Q9QYY0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gab1Q9QYY0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gab1Q9QYY0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gab1Q9QYY0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gab1Q9QYY0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gab1Q9QYY0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gab1Q9QYY0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gab1Q9QYY0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gab1Q9QYY0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gab1Q9QYY0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gab1Q9QYY0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gab1Q9QYY0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gab1Q9QYY0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gab1Q9QYY0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gab1Q9QYY0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gab1Q9QYY0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gab1Q9QYY0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gab1Q9QYY0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gab1Q9QYY0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gab1Q9QYY0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gab1Q9QYY0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gab1Q9QYY0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gab1Q9QYY0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gab1Q9QYY0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gab1Q9QYY0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gab1Q9QYY0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gab1Q9QYY0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gab1Q9QYY0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gab1Q9QYY0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gab1Q9QYY0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gab1Q9QYY0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gab1Q9QYY0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Gab1Q9QYY0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Gab1Q9QYY0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gab1Q9QYY0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gab1Q9QYY0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gab1Q9QYY0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gab1Q9QYY0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gab1Q9QYY0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gab1Q9QYY0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gab1Q9QYY0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gab1Q9QYY0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gab1Q9QYY0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gab1Q9QYY0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gab1Q9QYY0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gab1Q9QYY0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gab1Q9QYY0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gab1Q9QYY0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gab1Q9QYY0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gab1Q9QYY0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gab1Q9QYY0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gab1Q9QYY0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gab1Q9QYY0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gab1Q9QYY0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gab1Q9QYY0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gab1Q9QYY0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gab1Q9QYY0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gab1Q9QYY0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gab1Q9QYY0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gab1Q9QYY0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gab1Q9QYY0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gab1Q9QYY0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gab1Q9QYY0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gab1Q9QYY0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gab1Q9QYY0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gab1Q9QYY0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gab1Q9QYY0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gab1Q9QYY0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gab1Q9QYY0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gab1Q9QYY0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gab1Q9QYY0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gab1Q9QYY0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gab1Q9QYY0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gab1Q9QYY0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gab1Q9QYY0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gab1Q9QYY0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms