Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY30

Abcb11, Bile salt export pump, mousemouse

Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb11Q9QY30 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcb11Q9QY30 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcb11Q9QY30 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcb11Q9QY30 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcb11Q9QY30 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcb11Q9QY30 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcb11Q9QY30 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcb11Q9QY30 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcb11Q9QY30 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcb11Q9QY30 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcb11Q9QY30 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcb11Q9QY30 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcb11Q9QY30 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcb11Q9QY30 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcb11Q9QY30 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcb11Q9QY30 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcb11Q9QY30 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcb11Q9QY30 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcb11Q9QY30 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcb11Q9QY30 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcb11Q9QY30 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcb11Q9QY30 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcb11Q9QY30 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcb11Q9QY30 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcb11Q9QY30 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcb11Q9QY30 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcb11Q9QY30 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcb11Q9QY30 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcb11Q9QY30 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcb11Q9QY30 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Abcb11Q9QY30 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Abcb11Q9QY30 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Abcb11Q9QY30 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Abcb11Q9QY30 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Abcb11Q9QY30 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Abcb11Q9QY30 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Abcb11Q9QY30 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Abcb11Q9QY30 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Abcb11Q9QY30 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcb11Q9QY30 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcb11Q9QY30 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcb11Q9QY30 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcb11Q9QY30 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcb11Q9QY30 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcb11Q9QY30 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcb11Q9QY30 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcb11Q9QY30 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcb11Q9QY30 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcb11Q9QY30 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcb11Q9QY30 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcb11Q9QY30 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcb11Q9QY30 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcb11Q9QY30 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcb11Q9QY30 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcb11Q9QY30 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcb11Q9QY30 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcb11Q9QY30 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcb11Q9QY30 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcb11Q9QY30 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcb11Q9QY30 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcb11Q9QY30 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcb11Q9QY30 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcb11Q9QY30 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcb11Q9QY30 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcb11Q9QY30 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcb11Q9QY30 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcb11Q9QY30 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcb11Q9QY30 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcb11Q9QY30 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcb11Q9QY30 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcb11Q9QY30 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcb11Q9QY30 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcb11Q9QY30 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcb11Q9QY30 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcb11Q9QY30 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcb11Q9QY30 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcb11Q9QY30 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcb11Q9QY30 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcb11Q9QY30 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcb11Q9QY30 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcb11Q9QY30 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcb11Q9QY30 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcb11Q9QY30 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcb11Q9QY30 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcb11Q9QY30 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcb11Q9QY30 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcb11Q9QY30 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcb11Q9QY30 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcb11Q9QY30 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcb11Q9QY30 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcb11Q9QY30 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcb11Q9QY30 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcb11Q9QY30 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcb11Q9QY30 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcb11Q9QY30 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcb11Q9QY30 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcb11Q9QY30 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcb11Q9QY30 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcb11Q9QY30 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcb11Q9QY30 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms