Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkp3Q9QY23 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkp3Q9QY23 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkp3Q9QY23 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkp3Q9QY23 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pkp3Q9QY23 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pkp3Q9QY23 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pkp3Q9QY23 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pkp3Q9QY23 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pkp3Q9QY23 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pkp3Q9QY23 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pkp3Q9QY23 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pkp3Q9QY23 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pkp3Q9QY23 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pkp3Q9QY23 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pkp3Q9QY23 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pkp3Q9QY23 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pkp3Q9QY23 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pkp3Q9QY23 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pkp3Q9QY23 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pkp3Q9QY23 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pkp3Q9QY23 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pkp3Q9QY23 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pkp3Q9QY23 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pkp3Q9QY23 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pkp3Q9QY23 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pkp3Q9QY23 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pkp3Q9QY23 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Pkp3Q9QY23 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pkp3Q9QY23 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pkp3Q9QY23 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pkp3Q9QY23 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pkp3Q9QY23 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pkp3Q9QY23 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pkp3Q9QY23 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pkp3Q9QY23 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pkp3Q9QY23 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pkp3Q9QY23 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pkp3Q9QY23 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Pkp3Q9QY23 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Pkp3Q9QY23 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pkp3Q9QY23 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pkp3Q9QY23 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pkp3Q9QY23 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pkp3Q9QY23 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pkp3Q9QY23 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pkp3Q9QY23 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pkp3Q9QY23 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Pkp3Q9QY23 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pkp3Q9QY23 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pkp3Q9QY23 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pkp3Q9QY23 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pkp3Q9QY23 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pkp3Q9QY23 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pkp3Q9QY23 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pkp3Q9QY23 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pkp3Q9QY23 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pkp3Q9QY23 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pkp3Q9QY23 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pkp3Q9QY23 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pkp3Q9QY23 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pkp3Q9QY23 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pkp3Q9QY23 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pkp3Q9QY23 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Pkp3Q9QY23 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pkp3Q9QY23 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pkp3Q9QY23 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pkp3Q9QY23 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pkp3Q9QY23 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkp3Q9QY23 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkp3Q9QY23 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkp3Q9QY23 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkp3Q9QY23 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkp3Q9QY23 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkp3Q9QY23 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkp3Q9QY23 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkp3Q9QY23 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkp3Q9QY23 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkp3Q9QY23 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkp3Q9QY23 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkp3Q9QY23 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkp3Q9QY23 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkp3Q9QY23 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkp3Q9QY23 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkp3Q9QY23 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pkp3Q9QY23 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pkp3Q9QY23 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pkp3Q9QY23 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pkp3Q9QY23 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pkp3Q9QY23 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pkp3Q9QY23 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pkp3Q9QY23 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pkp3Q9QY23 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pkp3Q9QY23 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pkp3Q9QY23 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pkp3Q9QY23 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkp3Q9QY23 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkp3Q9QY23 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkp3Q9QY23 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkp3Q9QY23 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms