Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nufip1Q9QXX8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nufip1Q9QXX8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nufip1Q9QXX8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nufip1Q9QXX8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nufip1Q9QXX8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nufip1Q9QXX8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nufip1Q9QXX8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nufip1Q9QXX8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nufip1Q9QXX8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nufip1Q9QXX8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nufip1Q9QXX8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nufip1Q9QXX8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nufip1Q9QXX8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.6 ms