Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXW4

Fscn3, Fascin-3, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fscn3Q9QXW4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fscn3Q9QXW4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fscn3Q9QXW4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Fscn3Q9QXW4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fscn3Q9QXW4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fscn3Q9QXW4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fscn3Q9QXW4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fscn3Q9QXW4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fscn3Q9QXW4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fscn3Q9QXW4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fscn3Q9QXW4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fscn3Q9QXW4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fscn3Q9QXW4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fscn3Q9QXW4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fscn3Q9QXW4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Fscn3Q9QXW4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fscn3Q9QXW4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fscn3Q9QXW4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fscn3Q9QXW4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fscn3Q9QXW4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fscn3Q9QXW4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Fscn3Q9QXW4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fscn3Q9QXW4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fscn3Q9QXW4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fscn3Q9QXW4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fscn3Q9QXW4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fscn3Q9QXW4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fscn3Q9QXW4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fscn3Q9QXW4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fscn3Q9QXW4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fscn3Q9QXW4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fscn3Q9QXW4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fscn3Q9QXW4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Fscn3Q9QXW4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fscn3Q9QXW4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fscn3Q9QXW4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Fscn3Q9QXW4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Fscn3Q9QXW4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Fscn3Q9QXW4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fscn3Q9QXW4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms