Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcsk1nQ9QXV0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcsk1nQ9QXV0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcsk1nQ9QXV0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcsk1nQ9QXV0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcsk1nQ9QXV0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcsk1nQ9QXV0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcsk1nQ9QXV0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcsk1nQ9QXV0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcsk1nQ9QXV0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcsk1nQ9QXV0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcsk1nQ9QXV0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcsk1nQ9QXV0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcsk1nQ9QXV0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcsk1nQ9QXV0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcsk1nQ9QXV0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcsk1nQ9QXV0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pcsk1nQ9QXV0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pcsk1nQ9QXV0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcsk1nQ9QXV0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pcsk1nQ9QXV0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Pcsk1nQ9QXV0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pcsk1nQ9QXV0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcsk1nQ9QXV0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcsk1nQ9QXV0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcsk1nQ9QXV0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcsk1nQ9QXV0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcsk1nQ9QXV0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pcsk1nQ9QXV0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcsk1nQ9QXV0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcsk1nQ9QXV0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcsk1nQ9QXV0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pcsk1nQ9QXV0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Pcsk1nQ9QXV0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcsk1nQ9QXV0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcsk1nQ9QXV0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcsk1nQ9QXV0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pcsk1nQ9QXV0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Pcsk1nQ9QXV0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Pcsk1nQ9QXV0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms