Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms