Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cln8Q9QUK3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cln8Q9QUK3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cln8Q9QUK3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cln8Q9QUK3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cln8Q9QUK3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cln8Q9QUK3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cln8Q9QUK3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cln8Q9QUK3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cln8Q9QUK3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cln8Q9QUK3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cln8Q9QUK3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cln8Q9QUK3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cln8Q9QUK3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cln8Q9QUK3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cln8Q9QUK3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cln8Q9QUK3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cln8Q9QUK3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cln8Q9QUK3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cln8Q9QUK3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cln8Q9QUK3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cln8Q9QUK3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cln8Q9QUK3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cln8Q9QUK3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cln8Q9QUK3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cln8Q9QUK3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cln8Q9QUK3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cln8Q9QUK3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cln8Q9QUK3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cln8Q9QUK3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cln8Q9QUK3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cln8Q9QUK3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cln8Q9QUK3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cln8Q9QUK3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cln8Q9QUK3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cln8Q9QUK3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cln8Q9QUK3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cln8Q9QUK3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cln8Q9QUK3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cln8Q9QUK3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cln8Q9QUK3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cln8Q9QUK3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cln8Q9QUK3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cln8Q9QUK3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cln8Q9QUK3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cln8Q9QUK3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cln8Q9QUK3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cln8Q9QUK3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms