Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cul3Q9JLV5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cul3Q9JLV5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cul3Q9JLV5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cul3Q9JLV5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cul3Q9JLV5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cul3Q9JLV5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cul3Q9JLV5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cul3Q9JLV5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cul3Q9JLV5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cul3Q9JLV5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cul3Q9JLV5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cul3Q9JLV5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cul3Q9JLV5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cul3Q9JLV5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cul3Q9JLV5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cul3Q9JLV5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cul3Q9JLV5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cul3Q9JLV5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cul3Q9JLV5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cul3Q9JLV5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cul3Q9JLV5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cul3Q9JLV5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cul3Q9JLV5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cul3Q9JLV5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cul3Q9JLV5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cul3Q9JLV5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cul3Q9JLV5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cul3Q9JLV5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cul3Q9JLV5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cul3Q9JLV5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cul3Q9JLV5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cul3Q9JLV5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cul3Q9JLV5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cul3Q9JLV5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cul3Q9JLV5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cul3Q9JLV5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cul3Q9JLV5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cul3Q9JLV5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cul3Q9JLV5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cul3Q9JLV5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cul3Q9JLV5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cul3Q9JLV5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cul3Q9JLV5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cul3Q9JLV5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cul3Q9JLV5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cul3Q9JLV5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cul3Q9JLV5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cul3Q9JLV5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cul3Q9JLV5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cul3Q9JLV5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cul3Q9JLV5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cul3Q9JLV5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cul3Q9JLV5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cul3Q9JLV5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cul3Q9JLV5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cul3Q9JLV5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cul3Q9JLV5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cul3Q9JLV5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cul3Q9JLV5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cul3Q9JLV5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cul3Q9JLV5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cul3Q9JLV5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cul3Q9JLV5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cul3Q9JLV5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cul3Q9JLV5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cul3Q9JLV5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cul3Q9JLV5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cul3Q9JLV5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cul3Q9JLV5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cul3Q9JLV5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cul3Q9JLV5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cul3Q9JLV5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cul3Q9JLV5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cul3Q9JLV5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cul3Q9JLV5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cul3Q9JLV5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cul3Q9JLV5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cul3Q9JLV5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cul3Q9JLV5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cul3Q9JLV5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cul3Q9JLV5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cul3Q9JLV5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cul3Q9JLV5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cul3Q9JLV5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cul3Q9JLV5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms