Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLQ0

Cd2ap, CD2-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd2apQ9JLQ0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cd2apQ9JLQ0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cd2apQ9JLQ0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cd2apQ9JLQ0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cd2apQ9JLQ0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cd2apQ9JLQ0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd2apQ9JLQ0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd2apQ9JLQ0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd2apQ9JLQ0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd2apQ9JLQ0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd2apQ9JLQ0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd2apQ9JLQ0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd2apQ9JLQ0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cd2apQ9JLQ0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Cd2apQ9JLQ0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cd2apQ9JLQ0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Cd2apQ9JLQ0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cd2apQ9JLQ0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cd2apQ9JLQ0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cd2apQ9JLQ0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cd2apQ9JLQ0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cd2apQ9JLQ0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cd2apQ9JLQ0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cd2apQ9JLQ0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cd2apQ9JLQ0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cd2apQ9JLQ0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cd2apQ9JLQ0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cd2apQ9JLQ0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cd2apQ9JLQ0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cd2apQ9JLQ0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cd2apQ9JLQ0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cd2apQ9JLQ0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cd2apQ9JLQ0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cd2apQ9JLQ0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cd2apQ9JLQ0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cd2apQ9JLQ0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cd2apQ9JLQ0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cd2apQ9JLQ0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cd2apQ9JLQ0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cd2apQ9JLQ0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cd2apQ9JLQ0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cd2apQ9JLQ0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cd2apQ9JLQ0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cd2apQ9JLQ0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cd2apQ9JLQ0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cd2apQ9JLQ0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cd2apQ9JLQ0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cd2apQ9JLQ0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cd2apQ9JLQ0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cd2apQ9JLQ0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cd2apQ9JLQ0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cd2apQ9JLQ0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cd2apQ9JLQ0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cd2apQ9JLQ0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cd2apQ9JLQ0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cd2apQ9JLQ0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cd2apQ9JLQ0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cd2apQ9JLQ0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cd2apQ9JLQ0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cd2apQ9JLQ0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cd2apQ9JLQ0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cd2apQ9JLQ0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Cd2apQ9JLQ0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cd2apQ9JLQ0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cd2apQ9JLQ0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cd2apQ9JLQ0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cd2apQ9JLQ0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Cd2apQ9JLQ0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cd2apQ9JLQ0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cd2apQ9JLQ0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cd2apQ9JLQ0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cd2apQ9JLQ0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cd2apQ9JLQ0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cd2apQ9JLQ0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cd2apQ9JLQ0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cd2apQ9JLQ0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cd2apQ9JLQ0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cd2apQ9JLQ0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cd2apQ9JLQ0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cd2apQ9JLQ0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cd2apQ9JLQ0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cd2apQ9JLQ0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cd2apQ9JLQ0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cd2apQ9JLQ0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cd2apQ9JLQ0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cd2apQ9JLQ0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cd2apQ9JLQ0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cd2apQ9JLQ0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cd2apQ9JLQ0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cd2apQ9JLQ0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cd2apQ9JLQ0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cd2apQ9JLQ0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Cd2apQ9JLQ0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Cd2apQ9JLQ0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cd2apQ9JLQ0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cd2apQ9JLQ0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cd2apQ9JLQ0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cd2apQ9JLQ0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cd2apQ9JLQ0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cd2apQ9JLQ0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms