Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Cabp1Q9JLK7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Cabp1Q9JLK7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Cabp1Q9JLK7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Cabp1Q9JLK7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Cabp1Q9JLK7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Cabp1Q9JLK7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Cabp1Q9JLK7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Cabp1Q9JLK7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Cabp1Q9JLK7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Cabp1Q9JLK7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Cabp1Q9JLK7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Cabp1Q9JLK7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Cabp1Q9JLK7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Cabp1Q9JLK7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Cabp1Q9JLK7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Cabp1Q9JLK7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Cabp1Q9JLK7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Cabp1Q9JLK7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Cabp1Q9JLK7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Cabp1Q9JLK7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Cabp1Q9JLK7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Cabp1Q9JLK7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Cabp1Q9JLK7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Cabp1Q9JLK7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Cabp1Q9JLK7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Cabp1Q9JLK7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Cabp1Q9JLK7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Cabp1Q9JLK7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Cabp1Q9JLK7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Cabp1Q9JLK7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Cabp1Q9JLK7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Cabp1Q9JLK7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Cabp1Q9JLK7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Cabp1Q9JLK7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Cabp1Q9JLK7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Cabp1Q9JLK7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Cabp1Q9JLK7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Cabp1Q9JLK7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Cabp1Q9JLK7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Cabp1Q9JLK7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Cabp1Q9JLK7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Cabp1Q9JLK7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Cabp1Q9JLK7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Cabp1Q9JLK7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Cabp1Q9JLK7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Cabp1Q9JLK7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Cabp1Q9JLK7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Cabp1Q9JLK7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Cabp1Q9JLK7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Cabp1Q9JLK7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Cabp1Q9JLK7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Cabp1Q9JLK7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Cabp1Q9JLK7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Cabp1Q9JLK7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Cabp1Q9JLK7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Cabp1Q9JLK7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Cabp1Q9JLK7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cabp1Q9JLK7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cabp1Q9JLK7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cabp1Q9JLK7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cabp1Q9JLK7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cabp1Q9JLK7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cabp1Q9JLK7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cabp1Q9JLK7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cabp1Q9JLK7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cabp1Q9JLK7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cabp1Q9JLK7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cabp1Q9JLK7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cabp1Q9JLK7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cabp1Q9JLK7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cabp1Q9JLK7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Cabp1Q9JLK7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Cabp1Q9JLK7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Cabp1Q9JLK7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Cabp1Q9JLK7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Cabp1Q9JLK7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cabp1Q9JLK7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cabp1Q9JLK7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cabp1Q9JLK7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cabp1Q9JLK7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cabp1Q9JLK7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cabp1Q9JLK7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Cabp1Q9JLK7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Cabp1Q9JLK7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Cabp1Q9JLK7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Cabp1Q9JLK7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Cabp1Q9JLK7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Cabp1Q9JLK7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cabp1Q9JLK7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cabp1Q9JLK7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cabp1Q9JLK7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cabp1Q9JLK7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Cabp1Q9JLK7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cabp1Q9JLK7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cabp1Q9JLK7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cabp1Q9JLK7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cabp1Q9JLK7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Cabp1Q9JLK7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Cabp1Q9JLK7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms