Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

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Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Tgm1Q9JLF6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tgm1Q9JLF6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tgm1Q9JLF6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tgm1Q9JLF6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tgm1Q9JLF6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tgm1Q9JLF6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tgm1Q9JLF6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tgm1Q9JLF6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Tgm1Q9JLF6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tgm1Q9JLF6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tgm1Q9JLF6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tgm1Q9JLF6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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Tgm1Q9JLF6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tgm1Q9JLF6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tgm1Q9JLF6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tgm1Q9JLF6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tgm1Q9JLF6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tgm1Q9JLF6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tgm1Q9JLF6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tgm1Q9JLF6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tgm1Q9JLF6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tgm1Q9JLF6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tgm1Q9JLF6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tgm1Q9JLF6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tgm1Q9JLF6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tgm1Q9JLF6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Tgm1Q9JLF6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tgm1Q9JLF6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tgm1Q9JLF6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Tgm1Q9JLF6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Tgm1Q9JLF6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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Tgm1Q9JLF6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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Tgm1Q9JLF6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Tgm1Q9JLF6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Tgm1Q9JLF6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tgm1Q9JLF6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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Tgm1Q9JLF6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
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Tgm1Q9JLF6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Tgm1Q9JLF6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tgm1Q9JLF6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tgm1Q9JLF6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Tgm1Q9JLF6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tgm1Q9JLF6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tgm1Q9JLF6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tgm1Q9JLF6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tgm1Q9JLF6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tgm1Q9JLF6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tgm1Q9JLF6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tgm1Q9JLF6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tgm1Q9JLF6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tgm1Q9JLF6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tgm1Q9JLF6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tgm1Q9JLF6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tgm1Q9JLF6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tgm1Q9JLF6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tgm1Q9JLF6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tgm1Q9JLF6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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