Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC3

Msrb1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb1Q9JLC3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Msrb1Q9JLC3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Msrb1Q9JLC3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Msrb1Q9JLC3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Msrb1Q9JLC3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Msrb1Q9JLC3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Msrb1Q9JLC3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Msrb1Q9JLC3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Msrb1Q9JLC3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Msrb1Q9JLC3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Msrb1Q9JLC3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Msrb1Q9JLC3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Msrb1Q9JLC3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Msrb1Q9JLC3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Msrb1Q9JLC3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Msrb1Q9JLC3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Msrb1Q9JLC3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Msrb1Q9JLC3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Msrb1Q9JLC3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Msrb1Q9JLC3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Msrb1Q9JLC3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Msrb1Q9JLC3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Msrb1Q9JLC3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Msrb1Q9JLC3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Msrb1Q9JLC3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Msrb1Q9JLC3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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