Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKZ2

Slc5a3, Sodium/myo-inositol cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a3Q9JKZ2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc5a3Q9JKZ2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc5a3Q9JKZ2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc5a3Q9JKZ2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc5a3Q9JKZ2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc5a3Q9JKZ2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc5a3Q9JKZ2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc5a3Q9JKZ2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Slc5a3Q9JKZ2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms