Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx5Q9JKQ4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx5Q9JKQ4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx5Q9JKQ4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irx5Q9JKQ4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irx5Q9JKQ4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irx5Q9JKQ4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irx5Q9JKQ4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irx5Q9JKQ4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irx5Q9JKQ4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Irx5Q9JKQ4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irx5Q9JKQ4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irx5Q9JKQ4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irx5Q9JKQ4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Irx5Q9JKQ4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irx5Q9JKQ4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irx5Q9JKQ4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irx5Q9JKQ4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irx5Q9JKQ4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irx5Q9JKQ4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irx5Q9JKQ4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irx5Q9JKQ4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irx5Q9JKQ4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irx5Q9JKQ4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irx5Q9JKQ4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irx5Q9JKQ4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irx5Q9JKQ4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irx5Q9JKQ4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irx5Q9JKQ4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irx5Q9JKQ4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irx5Q9JKQ4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irx5Q9JKQ4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Irx5Q9JKQ4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irx5Q9JKQ4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irx5Q9JKQ4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx5Q9JKQ4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx5Q9JKQ4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx5Q9JKQ4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx5Q9JKQ4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx5Q9JKQ4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx5Q9JKQ4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx5Q9JKQ4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx5Q9JKQ4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx5Q9JKQ4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irx5Q9JKQ4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irx5Q9JKQ4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irx5Q9JKQ4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irx5Q9JKQ4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irx5Q9JKQ4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Irx5Q9JKQ4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx5Q9JKQ4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx5Q9JKQ4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx5Q9JKQ4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx5Q9JKQ4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx5Q9JKQ4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx5Q9JKQ4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx5Q9JKQ4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx5Q9JKQ4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx5Q9JKQ4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx5Q9JKQ4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx5Q9JKQ4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx5Q9JKQ4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irx5Q9JKQ4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irx5Q9JKQ4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irx5Q9JKQ4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Irx5Q9JKQ4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irx5Q9JKQ4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irx5Q9JKQ4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irx5Q9JKQ4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irx5Q9JKQ4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irx5Q9JKQ4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irx5Q9JKQ4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irx5Q9JKQ4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irx5Q9JKQ4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irx5Q9JKQ4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irx5Q9JKQ4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irx5Q9JKQ4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irx5Q9JKQ4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irx5Q9JKQ4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Irx5Q9JKQ4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irx5Q9JKQ4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Irx5Q9JKQ4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irx5Q9JKQ4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irx5Q9JKQ4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irx5Q9JKQ4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx5Q9JKQ4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx5Q9JKQ4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx5Q9JKQ4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx5Q9JKQ4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx5Q9JKQ4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx5Q9JKQ4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx5Q9JKQ4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx5Q9JKQ4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irx5Q9JKQ4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irx5Q9JKQ4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irx5Q9JKQ4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Irx5Q9JKQ4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Irx5Q9JKQ4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irx5Q9JKQ4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irx5Q9JKQ4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms