Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKL4

Ndufaf3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf3Q9JKL4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ndufaf3Q9JKL4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ndufaf3Q9JKL4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufaf3Q9JKL4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufaf3Q9JKL4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufaf3Q9JKL4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufaf3Q9JKL4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufaf3Q9JKL4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufaf3Q9JKL4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufaf3Q9JKL4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufaf3Q9JKL4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufaf3Q9JKL4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufaf3Q9JKL4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ndufaf3Q9JKL4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufaf3Q9JKL4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufaf3Q9JKL4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufaf3Q9JKL4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufaf3Q9JKL4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufaf3Q9JKL4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufaf3Q9JKL4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufaf3Q9JKL4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufaf3Q9JKL4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufaf3Q9JKL4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufaf3Q9JKL4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufaf3Q9JKL4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufaf3Q9JKL4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufaf3Q9JKL4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufaf3Q9JKL4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufaf3Q9JKL4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufaf3Q9JKL4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufaf3Q9JKL4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufaf3Q9JKL4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufaf3Q9JKL4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufaf3Q9JKL4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufaf3Q9JKL4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufaf3Q9JKL4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufaf3Q9JKL4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufaf3Q9JKL4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufaf3Q9JKL4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufaf3Q9JKL4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufaf3Q9JKL4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufaf3Q9JKL4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufaf3Q9JKL4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufaf3Q9JKL4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufaf3Q9JKL4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufaf3Q9JKL4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufaf3Q9JKL4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufaf3Q9JKL4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufaf3Q9JKL4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufaf3Q9JKL4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ndufaf3Q9JKL4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufaf3Q9JKL4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufaf3Q9JKL4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufaf3Q9JKL4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufaf3Q9JKL4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufaf3Q9JKL4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufaf3Q9JKL4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufaf3Q9JKL4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufaf3Q9JKL4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufaf3Q9JKL4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms