Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AtrQ9JKK8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AtrQ9JKK8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AtrQ9JKK8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AtrQ9JKK8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AtrQ9JKK8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AtrQ9JKK8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AtrQ9JKK8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AtrQ9JKK8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AtrQ9JKK8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AtrQ9JKK8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AtrQ9JKK8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
AtrQ9JKK8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
AtrQ9JKK8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
AtrQ9JKK8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AtrQ9JKK8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AtrQ9JKK8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AtrQ9JKK8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AtrQ9JKK8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AtrQ9JKK8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AtrQ9JKK8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
AtrQ9JKK8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
AtrQ9JKK8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AtrQ9JKK8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
AtrQ9JKK8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AtrQ9JKK8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
AtrQ9JKK8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AtrQ9JKK8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
AtrQ9JKK8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AtrQ9JKK8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AtrQ9JKK8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AtrQ9JKK8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AtrQ9JKK8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AtrQ9JKK8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AtrQ9JKK8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AtrQ9JKK8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AtrQ9JKK8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AtrQ9JKK8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AtrQ9JKK8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AtrQ9JKK8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AtrQ9JKK8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AtrQ9JKK8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AtrQ9JKK8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AtrQ9JKK8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AtrQ9JKK8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AtrQ9JKK8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AtrQ9JKK8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AtrQ9JKK8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
AtrQ9JKK8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AtrQ9JKK8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AtrQ9JKK8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AtrQ9JKK8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AtrQ9JKK8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AtrQ9JKK8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms