Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cyp39a1Q9JKJ9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cyp39a1Q9JKJ9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cyp39a1Q9JKJ9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cyp39a1Q9JKJ9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cyp39a1Q9JKJ9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cyp39a1Q9JKJ9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp39a1Q9JKJ9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms