Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Mrpl39Q9JKF7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms