Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ybx3Q9JKB3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ybx3Q9JKB3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ybx3Q9JKB3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ybx3Q9JKB3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Ybx3Q9JKB3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ybx3Q9JKB3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ybx3Q9JKB3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ybx3Q9JKB3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ybx3Q9JKB3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ybx3Q9JKB3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ybx3Q9JKB3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ybx3Q9JKB3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ybx3Q9JKB3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ybx3Q9JKB3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ybx3Q9JKB3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ybx3Q9JKB3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ybx3Q9JKB3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ybx3Q9JKB3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ybx3Q9JKB3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ybx3Q9JKB3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ybx3Q9JKB3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ybx3Q9JKB3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ybx3Q9JKB3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ybx3Q9JKB3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Ybx3Q9JKB3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ybx3Q9JKB3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ybx3Q9JKB3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Ybx3Q9JKB3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ybx3Q9JKB3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Ybx3Q9JKB3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ybx3Q9JKB3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ybx3Q9JKB3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ybx3Q9JKB3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ybx3Q9JKB3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Ybx3Q9JKB3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ybx3Q9JKB3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ybx3Q9JKB3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ybx3Q9JKB3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ybx3Q9JKB3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ybx3Q9JKB3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ybx3Q9JKB3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ybx3Q9JKB3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Ybx3Q9JKB3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Ybx3Q9JKB3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Ybx3Q9JKB3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Ybx3Q9JKB3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ybx3Q9JKB3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Ybx3Q9JKB3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ybx3Q9JKB3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ybx3Q9JKB3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ybx3Q9JKB3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ybx3Q9JKB3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Ybx3Q9JKB3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ybx3Q9JKB3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ybx3Q9JKB3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ybx3Q9JKB3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ybx3Q9JKB3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ybx3Q9JKB3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Ybx3Q9JKB3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ybx3Q9JKB3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ybx3Q9JKB3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ybx3Q9JKB3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ybx3Q9JKB3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ybx3Q9JKB3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Ybx3Q9JKB3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ybx3Q9JKB3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ybx3Q9JKB3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ybx3Q9JKB3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ybx3Q9JKB3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ybx3Q9JKB3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ybx3Q9JKB3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Ybx3Q9JKB3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ybx3Q9JKB3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ybx3Q9JKB3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ybx3Q9JKB3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Ybx3Q9JKB3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ybx3Q9JKB3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ybx3Q9JKB3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ybx3Q9JKB3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ybx3Q9JKB3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ybx3Q9JKB3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ybx3Q9JKB3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ybx3Q9JKB3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ybx3Q9JKB3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ybx3Q9JKB3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ybx3Q9JKB3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ybx3Q9JKB3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ybx3Q9JKB3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ybx3Q9JKB3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ybx3Q9JKB3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ybx3Q9JKB3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ybx3Q9JKB3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ybx3Q9JKB3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Ybx3Q9JKB3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ybx3Q9JKB3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ybx3Q9JKB3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ybx3Q9JKB3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ybx3Q9JKB3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ybx3Q9JKB3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms