Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Uchl3Q9JKB1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Uchl3Q9JKB1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Uchl3Q9JKB1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Uchl3Q9JKB1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Uchl3Q9JKB1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Uchl3Q9JKB1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Uchl3Q9JKB1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Uchl3Q9JKB1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Uchl3Q9JKB1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Uchl3Q9JKB1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Uchl3Q9JKB1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Uchl3Q9JKB1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Uchl3Q9JKB1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Uchl3Q9JKB1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Uchl3Q9JKB1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Uchl3Q9JKB1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Uchl3Q9JKB1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Uchl3Q9JKB1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Uchl3Q9JKB1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Uchl3Q9JKB1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Uchl3Q9JKB1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Uchl3Q9JKB1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Uchl3Q9JKB1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Uchl3Q9JKB1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Uchl3Q9JKB1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Uchl3Q9JKB1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Uchl3Q9JKB1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Uchl3Q9JKB1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Uchl3Q9JKB1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Uchl3Q9JKB1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Uchl3Q9JKB1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Uchl3Q9JKB1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Uchl3Q9JKB1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Uchl3Q9JKB1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uchl3Q9JKB1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uchl3Q9JKB1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uchl3Q9JKB1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uchl3Q9JKB1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uchl3Q9JKB1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uchl3Q9JKB1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uchl3Q9JKB1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uchl3Q9JKB1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uchl3Q9JKB1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uchl3Q9JKB1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uchl3Q9JKB1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Uchl3Q9JKB1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Uchl3Q9JKB1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Uchl3Q9JKB1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Uchl3Q9JKB1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Uchl3Q9JKB1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Uchl3Q9JKB1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Uchl3Q9JKB1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Uchl3Q9JKB1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Uchl3Q9JKB1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Uchl3Q9JKB1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Uchl3Q9JKB1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Uchl3Q9JKB1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Uchl3Q9JKB1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Uchl3Q9JKB1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Uchl3Q9JKB1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Uchl3Q9JKB1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Uchl3Q9JKB1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Uchl3Q9JKB1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Uchl3Q9JKB1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Uchl3Q9JKB1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Uchl3Q9JKB1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Uchl3Q9JKB1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Uchl3Q9JKB1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Uchl3Q9JKB1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Uchl3Q9JKB1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Uchl3Q9JKB1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Uchl3Q9JKB1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Uchl3Q9JKB1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Uchl3Q9JKB1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Uchl3Q9JKB1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Uchl3Q9JKB1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Uchl3Q9JKB1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Uchl3Q9JKB1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Uchl3Q9JKB1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Uchl3Q9JKB1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Uchl3Q9JKB1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Uchl3Q9JKB1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Uchl3Q9JKB1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Uchl3Q9JKB1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Uchl3Q9JKB1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Uchl3Q9JKB1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Uchl3Q9JKB1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Uchl3Q9JKB1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Uchl3Q9JKB1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Uchl3Q9JKB1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Uchl3Q9JKB1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Uchl3Q9JKB1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Uchl3Q9JKB1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Uchl3Q9JKB1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Uchl3Q9JKB1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Uchl3Q9JKB1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Uchl3Q9JKB1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Uchl3Q9JKB1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Uchl3Q9JKB1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms