Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gfra4Q9JJT2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gfra4Q9JJT2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gfra4Q9JJT2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gfra4Q9JJT2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gfra4Q9JJT2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gfra4Q9JJT2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gfra4Q9JJT2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gfra4Q9JJT2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gfra4Q9JJT2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gfra4Q9JJT2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gfra4Q9JJT2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gfra4Q9JJT2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gfra4Q9JJT2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gfra4Q9JJT2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gfra4Q9JJT2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gfra4Q9JJT2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gfra4Q9JJT2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gfra4Q9JJT2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gfra4Q9JJT2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gfra4Q9JJT2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gfra4Q9JJT2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gfra4Q9JJT2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gfra4Q9JJT2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gfra4Q9JJT2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gfra4Q9JJT2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gfra4Q9JJT2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gfra4Q9JJT2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gfra4Q9JJT2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gfra4Q9JJT2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gfra4Q9JJT2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gfra4Q9JJT2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gfra4Q9JJT2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gfra4Q9JJT2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gfra4Q9JJT2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gfra4Q9JJT2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gfra4Q9JJT2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gfra4Q9JJT2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gfra4Q9JJT2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gfra4Q9JJT2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gfra4Q9JJT2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gfra4Q9JJT2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gfra4Q9JJT2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gfra4Q9JJT2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gfra4Q9JJT2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gfra4Q9JJT2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gfra4Q9JJT2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gfra4Q9JJT2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gfra4Q9JJT2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gfra4Q9JJT2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gfra4Q9JJT2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gfra4Q9JJT2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gfra4Q9JJT2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gfra4Q9JJT2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gfra4Q9JJT2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Gfra4Q9JJT2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gfra4Q9JJT2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gfra4Q9JJT2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gfra4Q9JJT2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gfra4Q9JJT2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gfra4Q9JJT2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gfra4Q9JJT2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gfra4Q9JJT2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gfra4Q9JJT2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gfra4Q9JJT2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gfra4Q9JJT2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gfra4Q9JJT2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gfra4Q9JJT2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gfra4Q9JJT2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gfra4Q9JJT2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gfra4Q9JJT2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gfra4Q9JJT2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gfra4Q9JJT2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gfra4Q9JJT2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gfra4Q9JJT2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gfra4Q9JJT2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gfra4Q9JJT2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gfra4Q9JJT2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gfra4Q9JJT2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gfra4Q9JJT2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gfra4Q9JJT2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gfra4Q9JJT2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gfra4Q9JJT2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gfra4Q9JJT2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gfra4Q9JJT2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gfra4Q9JJT2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gfra4Q9JJT2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gfra4Q9JJT2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gfra4Q9JJT2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gfra4Q9JJT2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gfra4Q9JJT2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gfra4Q9JJT2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gfra4Q9JJT2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gfra4Q9JJT2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gfra4Q9JJT2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gfra4Q9JJT2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gfra4Q9JJT2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Gfra4Q9JJT2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gfra4Q9JJT2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gfra4Q9JJT2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms