Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT0

Rcl1, RNA 3'-terminal phosphate cyclase-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcl1Q9JJT0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rcl1Q9JJT0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rcl1Q9JJT0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rcl1Q9JJT0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rcl1Q9JJT0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rcl1Q9JJT0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rcl1Q9JJT0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rcl1Q9JJT0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rcl1Q9JJT0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rcl1Q9JJT0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rcl1Q9JJT0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rcl1Q9JJT0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rcl1Q9JJT0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rcl1Q9JJT0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rcl1Q9JJT0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rcl1Q9JJT0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rcl1Q9JJT0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rcl1Q9JJT0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rcl1Q9JJT0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rcl1Q9JJT0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rcl1Q9JJT0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rcl1Q9JJT0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rcl1Q9JJT0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rcl1Q9JJT0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rcl1Q9JJT0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rcl1Q9JJT0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rcl1Q9JJT0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rcl1Q9JJT0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rcl1Q9JJT0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms