Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Efcc1Q9JJF6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Efcc1Q9JJF6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Efcc1Q9JJF6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Efcc1Q9JJF6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Efcc1Q9JJF6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Efcc1Q9JJF6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Efcc1Q9JJF6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Efcc1Q9JJF6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Efcc1Q9JJF6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Efcc1Q9JJF6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Efcc1Q9JJF6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Efcc1Q9JJF6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Efcc1Q9JJF6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Efcc1Q9JJF6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Efcc1Q9JJF6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Efcc1Q9JJF6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Efcc1Q9JJF6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Efcc1Q9JJF6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Efcc1Q9JJF6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Efcc1Q9JJF6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Efcc1Q9JJF6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Efcc1Q9JJF6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Efcc1Q9JJF6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Efcc1Q9JJF6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Efcc1Q9JJF6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Efcc1Q9JJF6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Efcc1Q9JJF6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Efcc1Q9JJF6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Efcc1Q9JJF6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Efcc1Q9JJF6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Efcc1Q9JJF6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Efcc1Q9JJF6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Efcc1Q9JJF6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Efcc1Q9JJF6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Efcc1Q9JJF6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Efcc1Q9JJF6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Efcc1Q9JJF6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Efcc1Q9JJF6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Efcc1Q9JJF6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Efcc1Q9JJF6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Efcc1Q9JJF6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Efcc1Q9JJF6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Efcc1Q9JJF6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Efcc1Q9JJF6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Efcc1Q9JJF6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Efcc1Q9JJF6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Efcc1Q9JJF6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Efcc1Q9JJF6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Efcc1Q9JJF6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Efcc1Q9JJF6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Efcc1Q9JJF6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Efcc1Q9JJF6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Efcc1Q9JJF6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Efcc1Q9JJF6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Efcc1Q9JJF6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Efcc1Q9JJF6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Efcc1Q9JJF6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Efcc1Q9JJF6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Efcc1Q9JJF6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Efcc1Q9JJF6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Efcc1Q9JJF6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Efcc1Q9JJF6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Efcc1Q9JJF6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Efcc1Q9JJF6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Efcc1Q9JJF6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Efcc1Q9JJF6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Efcc1Q9JJF6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Efcc1Q9JJF6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Efcc1Q9JJF6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Efcc1Q9JJF6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Efcc1Q9JJF6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Efcc1Q9JJF6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Efcc1Q9JJF6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Efcc1Q9JJF6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Efcc1Q9JJF6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Efcc1Q9JJF6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Efcc1Q9JJF6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Efcc1Q9JJF6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Efcc1Q9JJF6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Efcc1Q9JJF6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Efcc1Q9JJF6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Efcc1Q9JJF6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Efcc1Q9JJF6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Efcc1Q9JJF6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Efcc1Q9JJF6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Efcc1Q9JJF6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Efcc1Q9JJF6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Efcc1Q9JJF6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Efcc1Q9JJF6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Efcc1Q9JJF6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Efcc1Q9JJF6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Efcc1Q9JJF6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Efcc1Q9JJF6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Efcc1Q9JJF6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Efcc1Q9JJF6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Efcc1Q9JJF6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Efcc1Q9JJF6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Efcc1Q9JJF6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Efcc1Q9JJF6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms