Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ94

Ssna1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssna1Q9JJ94 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssna1Q9JJ94 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssna1Q9JJ94 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssna1Q9JJ94 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssna1Q9JJ94 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssna1Q9JJ94 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssna1Q9JJ94 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssna1Q9JJ94 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssna1Q9JJ94 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssna1Q9JJ94 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssna1Q9JJ94 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssna1Q9JJ94 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssna1Q9JJ94 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssna1Q9JJ94 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssna1Q9JJ94 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssna1Q9JJ94 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssna1Q9JJ94 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssna1Q9JJ94 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssna1Q9JJ94 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssna1Q9JJ94 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssna1Q9JJ94 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssna1Q9JJ94 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ssna1Q9JJ94 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ssna1Q9JJ94 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssna1Q9JJ94 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssna1Q9JJ94 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssna1Q9JJ94 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssna1Q9JJ94 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssna1Q9JJ94 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssna1Q9JJ94 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms