Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ28

Flii, Protein flightless-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FliiQ9JJ28 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FliiQ9JJ28 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FliiQ9JJ28 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FliiQ9JJ28 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FliiQ9JJ28 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FliiQ9JJ28 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FliiQ9JJ28 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FliiQ9JJ28 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FliiQ9JJ28 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FliiQ9JJ28 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FliiQ9JJ28 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FliiQ9JJ28 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FliiQ9JJ28 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FliiQ9JJ28 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FliiQ9JJ28 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FliiQ9JJ28 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FliiQ9JJ28 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FliiQ9JJ28 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FliiQ9JJ28 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FliiQ9JJ28 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FliiQ9JJ28 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FliiQ9JJ28 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FliiQ9JJ28 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FliiQ9JJ28 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FliiQ9JJ28 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FliiQ9JJ28 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FliiQ9JJ28 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FliiQ9JJ28 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FliiQ9JJ28 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FliiQ9JJ28 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FliiQ9JJ28 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FliiQ9JJ28 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FliiQ9JJ28 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FliiQ9JJ28 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FliiQ9JJ28 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FliiQ9JJ28 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FliiQ9JJ28 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FliiQ9JJ28 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FliiQ9JJ28 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FliiQ9JJ28 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FliiQ9JJ28 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FliiQ9JJ28 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FliiQ9JJ28 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FliiQ9JJ28 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FliiQ9JJ28 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FliiQ9JJ28 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FliiQ9JJ28 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FliiQ9JJ28 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FliiQ9JJ28 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FliiQ9JJ28 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FliiQ9JJ28 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FliiQ9JJ28 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FliiQ9JJ28 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FliiQ9JJ28 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FliiQ9JJ28 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FliiQ9JJ28 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FliiQ9JJ28 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FliiQ9JJ28 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FliiQ9JJ28 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FliiQ9JJ28 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FliiQ9JJ28 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FliiQ9JJ28 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FliiQ9JJ28 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FliiQ9JJ28 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FliiQ9JJ28 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FliiQ9JJ28 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FliiQ9JJ28 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FliiQ9JJ28 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FliiQ9JJ28 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FliiQ9JJ28 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FliiQ9JJ28 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FliiQ9JJ28 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FliiQ9JJ28 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FliiQ9JJ28 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FliiQ9JJ28 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FliiQ9JJ28 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FliiQ9JJ28 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FliiQ9JJ28 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FliiQ9JJ28 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FliiQ9JJ28 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FliiQ9JJ28 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FliiQ9JJ28 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FliiQ9JJ28 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FliiQ9JJ28 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FliiQ9JJ28 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FliiQ9JJ28 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FliiQ9JJ28 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FliiQ9JJ28 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FliiQ9JJ28 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FliiQ9JJ28 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FliiQ9JJ28 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FliiQ9JJ28 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FliiQ9JJ28 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FliiQ9JJ28 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FliiQ9JJ28 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FliiQ9JJ28 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FliiQ9JJ28 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FliiQ9JJ28 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FliiQ9JJ28 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FliiQ9JJ28 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms