Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smad9Q9JIW5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Smad9Q9JIW5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smad9Q9JIW5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Smad9Q9JIW5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Smad9Q9JIW5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smad9Q9JIW5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smad9Q9JIW5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smad9Q9JIW5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smad9Q9JIW5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smad9Q9JIW5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smad9Q9JIW5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smad9Q9JIW5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smad9Q9JIW5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smad9Q9JIW5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smad9Q9JIW5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smad9Q9JIW5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smad9Q9JIW5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smad9Q9JIW5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smad9Q9JIW5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smad9Q9JIW5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smad9Q9JIW5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smad9Q9JIW5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smad9Q9JIW5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smad9Q9JIW5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smad9Q9JIW5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smad9Q9JIW5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smad9Q9JIW5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smad9Q9JIW5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smad9Q9JIW5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smad9Q9JIW5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smad9Q9JIW5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smad9Q9JIW5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smad9Q9JIW5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smad9Q9JIW5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smad9Q9JIW5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smad9Q9JIW5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smad9Q9JIW5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smad9Q9JIW5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smad9Q9JIW5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smad9Q9JIW5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smad9Q9JIW5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smad9Q9JIW5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smad9Q9JIW5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Smad9Q9JIW5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smad9Q9JIW5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smad9Q9JIW5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smad9Q9JIW5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smad9Q9JIW5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smad9Q9JIW5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smad9Q9JIW5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smad9Q9JIW5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smad9Q9JIW5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smad9Q9JIW5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms