Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmbr1Q9JIT0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmbr1Q9JIT0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lmbr1Q9JIT0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lmbr1Q9JIT0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lmbr1Q9JIT0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmbr1Q9JIT0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmbr1Q9JIT0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmbr1Q9JIT0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmbr1Q9JIT0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmbr1Q9JIT0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmbr1Q9JIT0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmbr1Q9JIT0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmbr1Q9JIT0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmbr1Q9JIT0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmbr1Q9JIT0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmbr1Q9JIT0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmbr1Q9JIT0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmbr1Q9JIT0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmbr1Q9JIT0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmbr1Q9JIT0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmbr1Q9JIT0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmbr1Q9JIT0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmbr1Q9JIT0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmbr1Q9JIT0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lmbr1Q9JIT0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lmbr1Q9JIT0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lmbr1Q9JIT0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lmbr1Q9JIT0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lmbr1Q9JIT0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmbr1Q9JIT0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmbr1Q9JIT0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmbr1Q9JIT0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmbr1Q9JIT0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmbr1Q9JIT0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lmbr1Q9JIT0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lmbr1Q9JIT0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lmbr1Q9JIT0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lmbr1Q9JIT0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lmbr1Q9JIT0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Lmbr1Q9JIT0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lmbr1Q9JIT0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lmbr1Q9JIT0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lmbr1Q9JIT0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lmbr1Q9JIT0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lmbr1Q9JIT0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmbr1Q9JIT0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmbr1Q9JIT0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmbr1Q9JIT0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmbr1Q9JIT0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmbr1Q9JIT0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmbr1Q9JIT0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmbr1Q9JIT0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmbr1Q9JIT0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmbr1Q9JIT0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmbr1Q9JIT0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmbr1Q9JIT0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmbr1Q9JIT0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmbr1Q9JIT0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmbr1Q9JIT0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmbr1Q9JIT0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmbr1Q9JIT0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmbr1Q9JIT0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmbr1Q9JIT0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmbr1Q9JIT0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmbr1Q9JIT0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmbr1Q9JIT0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmbr1Q9JIT0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmbr1Q9JIT0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmbr1Q9JIT0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmbr1Q9JIT0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmbr1Q9JIT0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmbr1Q9JIT0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmbr1Q9JIT0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmbr1Q9JIT0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmbr1Q9JIT0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmbr1Q9JIT0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmbr1Q9JIT0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmbr1Q9JIT0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmbr1Q9JIT0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmbr1Q9JIT0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmbr1Q9JIT0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmbr1Q9JIT0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmbr1Q9JIT0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmbr1Q9JIT0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmbr1Q9JIT0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmbr1Q9JIT0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmbr1Q9JIT0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmbr1Q9JIT0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmbr1Q9JIT0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmbr1Q9JIT0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmbr1Q9JIT0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmbr1Q9JIT0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmbr1Q9JIT0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmbr1Q9JIT0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmbr1Q9JIT0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lmbr1Q9JIT0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lmbr1Q9JIT0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lmbr1Q9JIT0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lmbr1Q9JIT0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms