Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacna1fQ9JIS7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacna1fQ9JIS7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacna1fQ9JIS7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacna1fQ9JIS7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacna1fQ9JIS7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacna1fQ9JIS7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacna1fQ9JIS7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacna1fQ9JIS7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacna1fQ9JIS7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacna1fQ9JIS7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacna1fQ9JIS7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacna1fQ9JIS7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacna1fQ9JIS7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacna1fQ9JIS7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacna1fQ9JIS7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacna1fQ9JIS7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacna1fQ9JIS7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacna1fQ9JIS7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cacna1fQ9JIS7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cacna1fQ9JIS7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cacna1fQ9JIS7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cacna1fQ9JIS7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cacna1fQ9JIS7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cacna1fQ9JIS7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cacna1fQ9JIS7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacna1fQ9JIS7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacna1fQ9JIS7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacna1fQ9JIS7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacna1fQ9JIS7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacna1fQ9JIS7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacna1fQ9JIS7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacna1fQ9JIS7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacna1fQ9JIS7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacna1fQ9JIS7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cacna1fQ9JIS7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cacna1fQ9JIS7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cacna1fQ9JIS7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cacna1fQ9JIS7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cacna1fQ9JIS7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cacna1fQ9JIS7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Cacna1fQ9JIS7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cacna1fQ9JIS7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cacna1fQ9JIS7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cacna1fQ9JIS7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cacna1fQ9JIS7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cacna1fQ9JIS7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Cacna1fQ9JIS7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cacna1fQ9JIS7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cacna1fQ9JIS7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cacna1fQ9JIS7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cacna1fQ9JIS7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cacna1fQ9JIS7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cacna1fQ9JIS7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacna1fQ9JIS7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacna1fQ9JIS7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacna1fQ9JIS7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacna1fQ9JIS7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacna1fQ9JIS7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacna1fQ9JIS7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacna1fQ9JIS7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacna1fQ9JIS7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacna1fQ9JIS7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacna1fQ9JIS7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacna1fQ9JIS7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cacna1fQ9JIS7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cacna1fQ9JIS7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cacna1fQ9JIS7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cacna1fQ9JIS7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cacna1fQ9JIS7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Cacna1fQ9JIS7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cacna1fQ9JIS7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Cacna1fQ9JIS7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cacna1fQ9JIS7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cacna1fQ9JIS7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cacna1fQ9JIS7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cacna1fQ9JIS7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cacna1fQ9JIS7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cacna1fQ9JIS7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cacna1fQ9JIS7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Cacna1fQ9JIS7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cacna1fQ9JIS7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cacna1fQ9JIS7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacna1fQ9JIS7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacna1fQ9JIS7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacna1fQ9JIS7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacna1fQ9JIS7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacna1fQ9JIS7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacna1fQ9JIS7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cacna1fQ9JIS7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cacna1fQ9JIS7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cacna1fQ9JIS7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cacna1fQ9JIS7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cacna1fQ9JIS7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cacna1fQ9JIS7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cacna1fQ9JIS7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cacna1fQ9JIS7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cacna1fQ9JIS7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cacna1fQ9JIS7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Cacna1fQ9JIS7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms