Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ercc6l2Q9JIM3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ercc6l2Q9JIM3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ercc6l2Q9JIM3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ercc6l2Q9JIM3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ercc6l2Q9JIM3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ercc6l2Q9JIM3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ercc6l2Q9JIM3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ercc6l2Q9JIM3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ercc6l2Q9JIM3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ercc6l2Q9JIM3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ercc6l2Q9JIM3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ercc6l2Q9JIM3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ercc6l2Q9JIM3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Ercc6l2Q9JIM3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ercc6l2Q9JIM3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ercc6l2Q9JIM3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Ercc6l2Q9JIM3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ercc6l2Q9JIM3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ercc6l2Q9JIM3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ercc6l2Q9JIM3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ercc6l2Q9JIM3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ercc6l2Q9JIM3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ercc6l2Q9JIM3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Ercc6l2Q9JIM3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ercc6l2Q9JIM3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ercc6l2Q9JIM3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ercc6l2Q9JIM3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ercc6l2Q9JIM3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ercc6l2Q9JIM3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ercc6l2Q9JIM3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ercc6l2Q9JIM3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ercc6l2Q9JIM3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ercc6l2Q9JIM3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ercc6l2Q9JIM3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ercc6l2Q9JIM3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ercc6l2Q9JIM3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ercc6l2Q9JIM3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ercc6l2Q9JIM3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ercc6l2Q9JIM3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ercc6l2Q9JIM3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ercc6l2Q9JIM3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ercc6l2Q9JIM3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ercc6l2Q9JIM3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ercc6l2Q9JIM3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Ercc6l2Q9JIM3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ercc6l2Q9JIM3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ercc6l2Q9JIM3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ercc6l2Q9JIM3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ercc6l2Q9JIM3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Ercc6l2Q9JIM3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ercc6l2Q9JIM3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ercc6l2Q9JIM3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ercc6l2Q9JIM3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Ercc6l2Q9JIM3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ercc6l2Q9JIM3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ercc6l2Q9JIM3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Ercc6l2Q9JIM3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ercc6l2Q9JIM3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Ercc6l2Q9JIM3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ercc6l2Q9JIM3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ercc6l2Q9JIM3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ercc6l2Q9JIM3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ercc6l2Q9JIM3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ercc6l2Q9JIM3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ercc6l2Q9JIM3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ercc6l2Q9JIM3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Ercc6l2Q9JIM3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ercc6l2Q9JIM3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ercc6l2Q9JIM3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ercc6l2Q9JIM3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ercc6l2Q9JIM3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ercc6l2Q9JIM3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ercc6l2Q9JIM3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ercc6l2Q9JIM3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ercc6l2Q9JIM3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Ercc6l2Q9JIM3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Ercc6l2Q9JIM3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ercc6l2Q9JIM3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ercc6l2Q9JIM3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ercc6l2Q9JIM3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ercc6l2Q9JIM3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ercc6l2Q9JIM3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ercc6l2Q9JIM3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ercc6l2Q9JIM3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ercc6l2Q9JIM3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ercc6l2Q9JIM3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ercc6l2Q9JIM3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ercc6l2Q9JIM3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Ercc6l2Q9JIM3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ercc6l2Q9JIM3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ercc6l2Q9JIM3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ercc6l2Q9JIM3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ercc6l2Q9JIM3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ercc6l2Q9JIM3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ercc6l2Q9JIM3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ercc6l2Q9JIM3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ercc6l2Q9JIM3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ercc6l2Q9JIM3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms