Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2ird1Q9JI57 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2ird1Q9JI57 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2ird1Q9JI57 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2ird1Q9JI57 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2ird1Q9JI57 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2ird1Q9JI57 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2ird1Q9JI57 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2ird1Q9JI57 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf2ird1Q9JI57 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf2ird1Q9JI57 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf2ird1Q9JI57 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf2ird1Q9JI57 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf2ird1Q9JI57 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf2ird1Q9JI57 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2ird1Q9JI57 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2ird1Q9JI57 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2ird1Q9JI57 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2ird1Q9JI57 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2ird1Q9JI57 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2ird1Q9JI57 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf2ird1Q9JI57 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf2ird1Q9JI57 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf2ird1Q9JI57 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gtf2ird1Q9JI57 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2ird1Q9JI57 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2ird1Q9JI57 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2ird1Q9JI57 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2ird1Q9JI57 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2ird1Q9JI57 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2ird1Q9JI57 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2ird1Q9JI57 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2ird1Q9JI57 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2ird1Q9JI57 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2ird1Q9JI57 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2ird1Q9JI57 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2ird1Q9JI57 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2ird1Q9JI57 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2ird1Q9JI57 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2ird1Q9JI57 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2ird1Q9JI57 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2ird1Q9JI57 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2ird1Q9JI57 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2ird1Q9JI57 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2ird1Q9JI57 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf2ird1Q9JI57 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf2ird1Q9JI57 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf2ird1Q9JI57 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf2ird1Q9JI57 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf2ird1Q9JI57 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf2ird1Q9JI57 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2ird1Q9JI57 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2ird1Q9JI57 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2ird1Q9JI57 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2ird1Q9JI57 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2ird1Q9JI57 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2ird1Q9JI57 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2ird1Q9JI57 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2ird1Q9JI57 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2ird1Q9JI57 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2ird1Q9JI57 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2ird1Q9JI57 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2ird1Q9JI57 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2ird1Q9JI57 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2ird1Q9JI57 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf2ird1Q9JI57 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf2ird1Q9JI57 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf2ird1Q9JI57 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf2ird1Q9JI57 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf2ird1Q9JI57 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf2ird1Q9JI57 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf2ird1Q9JI57 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf2ird1Q9JI57 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf2ird1Q9JI57 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf2ird1Q9JI57 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf2ird1Q9JI57 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf2ird1Q9JI57 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2ird1Q9JI57 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2ird1Q9JI57 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2ird1Q9JI57 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2ird1Q9JI57 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2ird1Q9JI57 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2ird1Q9JI57 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2ird1Q9JI57 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2ird1Q9JI57 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2ird1Q9JI57 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2ird1Q9JI57 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2ird1Q9JI57 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2ird1Q9JI57 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2ird1Q9JI57 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2ird1Q9JI57 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf2ird1Q9JI57 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf2ird1Q9JI57 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf2ird1Q9JI57 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf2ird1Q9JI57 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms