Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmod3Q9JHJ0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmod3Q9JHJ0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmod3Q9JHJ0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmod3Q9JHJ0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmod3Q9JHJ0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmod3Q9JHJ0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmod3Q9JHJ0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmod3Q9JHJ0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmod3Q9JHJ0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmod3Q9JHJ0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmod3Q9JHJ0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmod3Q9JHJ0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmod3Q9JHJ0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmod3Q9JHJ0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmod3Q9JHJ0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmod3Q9JHJ0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmod3Q9JHJ0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmod3Q9JHJ0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmod3Q9JHJ0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmod3Q9JHJ0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmod3Q9JHJ0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmod3Q9JHJ0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmod3Q9JHJ0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmod3Q9JHJ0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmod3Q9JHJ0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmod3Q9JHJ0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmod3Q9JHJ0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmod3Q9JHJ0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmod3Q9JHJ0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmod3Q9JHJ0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmod3Q9JHJ0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmod3Q9JHJ0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmod3Q9JHJ0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tmod3Q9JHJ0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tmod3Q9JHJ0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmod3Q9JHJ0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmod3Q9JHJ0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmod3Q9JHJ0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmod3Q9JHJ0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmod3Q9JHJ0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmod3Q9JHJ0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmod3Q9JHJ0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmod3Q9JHJ0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmod3Q9JHJ0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmod3Q9JHJ0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmod3Q9JHJ0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmod3Q9JHJ0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmod3Q9JHJ0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmod3Q9JHJ0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmod3Q9JHJ0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmod3Q9JHJ0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmod3Q9JHJ0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmod3Q9JHJ0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmod3Q9JHJ0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmod3Q9JHJ0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmod3Q9JHJ0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmod3Q9JHJ0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmod3Q9JHJ0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmod3Q9JHJ0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmod3Q9JHJ0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmod3Q9JHJ0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmod3Q9JHJ0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmod3Q9JHJ0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmod3Q9JHJ0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmod3Q9JHJ0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmod3Q9JHJ0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmod3Q9JHJ0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmod3Q9JHJ0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmod3Q9JHJ0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmod3Q9JHJ0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmod3Q9JHJ0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmod3Q9JHJ0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmod3Q9JHJ0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmod3Q9JHJ0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmod3Q9JHJ0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmod3Q9JHJ0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmod3Q9JHJ0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmod3Q9JHJ0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmod3Q9JHJ0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmod3Q9JHJ0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmod3Q9JHJ0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmod3Q9JHJ0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmod3Q9JHJ0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmod3Q9JHJ0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmod3Q9JHJ0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmod3Q9JHJ0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmod3Q9JHJ0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmod3Q9JHJ0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmod3Q9JHJ0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmod3Q9JHJ0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmod3Q9JHJ0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmod3Q9JHJ0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmod3Q9JHJ0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmod3Q9JHJ0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmod3Q9JHJ0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmod3Q9JHJ0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmod3Q9JHJ0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmod3Q9JHJ0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmod3Q9JHJ0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
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