Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHH5

Cxcl11, C-X-C motif chemokine 11, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl11Q9JHH5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cxcl11Q9JHH5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cxcl11Q9JHH5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cxcl11Q9JHH5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cxcl11Q9JHH5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cxcl11Q9JHH5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cxcl11Q9JHH5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cxcl11Q9JHH5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cxcl11Q9JHH5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cxcl11Q9JHH5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cxcl11Q9JHH5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cxcl11Q9JHH5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cxcl11Q9JHH5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cxcl11Q9JHH5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cxcl11Q9JHH5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cxcl11Q9JHH5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cxcl11Q9JHH5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cxcl11Q9JHH5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cxcl11Q9JHH5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cxcl11Q9JHH5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cxcl11Q9JHH5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cxcl11Q9JHH5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cxcl11Q9JHH5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cxcl11Q9JHH5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cxcl11Q9JHH5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cxcl11Q9JHH5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cxcl11Q9JHH5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cxcl11Q9JHH5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cxcl11Q9JHH5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cxcl11Q9JHH5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cxcl11Q9JHH5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cxcl11Q9JHH5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cxcl11Q9JHH5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cxcl11Q9JHH5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cxcl11Q9JHH5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cxcl11Q9JHH5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cxcl11Q9JHH5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cxcl11Q9JHH5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cxcl11Q9JHH5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cxcl11Q9JHH5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cxcl11Q9JHH5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cxcl11Q9JHH5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cxcl11Q9JHH5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cxcl11Q9JHH5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cxcl11Q9JHH5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cxcl11Q9JHH5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cxcl11Q9JHH5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cxcl11Q9JHH5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cxcl11Q9JHH5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cxcl11Q9JHH5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cxcl11Q9JHH5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cxcl11Q9JHH5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cxcl11Q9JHH5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cxcl11Q9JHH5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cxcl11Q9JHH5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cxcl11Q9JHH5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cxcl11Q9JHH5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cxcl11Q9JHH5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cxcl11Q9JHH5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cxcl11Q9JHH5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cxcl11Q9JHH5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cxcl11Q9JHH5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cxcl11Q9JHH5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cxcl11Q9JHH5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cxcl11Q9JHH5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cxcl11Q9JHH5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cxcl11Q9JHH5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cxcl11Q9JHH5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cxcl11Q9JHH5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cxcl11Q9JHH5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cxcl11Q9JHH5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cxcl11Q9JHH5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cxcl11Q9JHH5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cxcl11Q9JHH5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cxcl11Q9JHH5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cxcl11Q9JHH5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cxcl11Q9JHH5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cxcl11Q9JHH5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cxcl11Q9JHH5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cxcl11Q9JHH5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cxcl11Q9JHH5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cxcl11Q9JHH5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cxcl11Q9JHH5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cxcl11Q9JHH5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cxcl11Q9JHH5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cxcl11Q9JHH5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cxcl11Q9JHH5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cxcl11Q9JHH5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cxcl11Q9JHH5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cxcl11Q9JHH5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cxcl11Q9JHH5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cxcl11Q9JHH5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cxcl11Q9JHH5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cxcl11Q9JHH5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cxcl11Q9JHH5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cxcl11Q9JHH5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cxcl11Q9JHH5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cxcl11Q9JHH5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cxcl11Q9JHH5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cxcl11Q9JHH5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms